玻璃钢脱硫塔的初始投资略低于同等处理能力的不锈钢塔，远低于钛合金塔。潍坊市科林环保设备有限公司对一百吨锅炉配套脱硫塔的成本分析表明，玻璃钢塔体造价约为不锈钢塔的百分之八十，为钛合金塔的百分之三十至四十。较低的初始投资降低了用户的资金压力。
玻璃钢脱硫塔的运行维护成本优势更加明显。潍坊市科林环保设备有限公司统计的用户运行数据显示，玻璃钢脱硫塔年维护费用约为设备原值的百分之一至二，而碳钢塔由于需要定期防腐修复，年维护费用高达百分之五至八。玻璃钢塔不需要内衬修补和涂装，维护工作量小。
玻璃钢锅炉脱硫塔的使用寿命可达十五至二十年。潍坊市科林环保设备有限公司最早交付的一批玻璃钢脱硫塔已运行超过十五年，经检测塔体壁厚减薄不足百分之十，结构强度和防腐性能仍满足使用要求。全生命周期成本核算表明，玻璃钢脱硫塔的综合经济性优于金属塔。
